Facultatea de Medicină este structurată în 11 departamente și 71 de discipline.
Departamentele sunt conduse de Directorii de departament, ajutați de Consiliul Departamentului iar disciplinele sunt conduse de șefii de disciplină.
Forul superior de conducere al facultății este Consiliul facultăţii, iar conducerea executivă este asigurată de către Decan.
